击败司马懿后，玩家需要前往洛阳城的皇宫触发最终剧情。皇宫内空空如也，仅有一名NPC会提示刘备帝君明日即达，这意味着游戏即将进入结局阶段。务必手动存档，因为游戏不会在结局前自动保存进度。次日再次进入皇宫即可观看大结局动画，完成整个游戏的主线流程。
若在司马懿战后尚未完成特定支线任务，例如黄石公的茶叶任务或八卦阵破解任务，则需要优先处理这些内容。黄石公位于街亭附近的山上，会要求玩家依次获取上等茶叶、优质沏茶水和精美茶具，最终传授落雷咒口诀以对抗司马懿的落雷计。八卦阵则需要先在五丈原关口购买九转丹，再前往地图右上角村庄对赤松子使用该道具，获取石阵出口坐标后才能通过。
游戏后期部分隐藏道具和装备仍可收集，例如项羽护手、速攻鞋等，这些物品可通过探索高老庄、洞穴等地点获取。建议在最终决战前整理队伍装备，确保主力武将配备最强武器和防具，如诸刃斧、藤甲等。同时需准备充足的智复丹和野营帐，以应对连续的剧情战斗。
完成所有任务后，玩家将进入结局动画，回顾刘备军的征战历程。需部分改版或非官方版本可能包含额外剧情，例如庞统复活等隐藏任务，但原版游戏在司马懿战后仅剩结局流程。通关后可根据存档继续探索未完成的支线或收集要素，但主线剧情至此全部结束。
