华佗作为少年三国志中兼具治疗与控制能力的核心辅助武将，其团队搭配主要围绕群雄阵营体系展开。在标准群雄国家队中，华佗常与吕布、袁绍、左慈等武将组成阵容，利用阵营加成提升整体属性。其中吕布作为主输出手依赖华佗的持续治疗维持生存，袁绍通过召唤弓兵提供额外火力，而左慈的减伤效果与华佗的治疗形成双重保护机制。这种组合充分发挥了华佗的群体恢复能力，尤其适合持久战场景。
在毒爆流派阵容中，华佗与贾诩、于吉等武将形成特殊配合。贾诩的毒伤效果需要时间叠加，华佗的群体治疗能有效延长队伍生存时间，确保毒伤发挥最大效果。于吉的全场攻击可触发华佗被动治疗，形成攻守联动。此类阵容对华佗的技能释放时机要求较高，需优先保证主力输出的存活，而非单纯追求治疗量。
针对PVE副本挑战，华佗可替代传统辅助如袁绍，与公孙瓒、董卓等武将搭配。公孙瓒的高暴击特性受益于华佗提供的暴击率加成，而董卓作为前排坦克能吸引火力，为华佗创造安全的治疗环境。这种组合尤其适合需要免疫特定伤害的关卡，华佗的群体护盾和免控效果能显著降低通关难度。
在后期高阶阵容中，华佗可与神武将组成五神体系，例如搭配神庞统、神诸葛亮等。神武将的全体属性加成进一步放大华佗的治疗收益，而神诸葛亮的控制技能与华佗的净化效果形成互补。此类阵容虽培养成本较高，但能最大限度发挥华佗的战场统治力，尤其在竞技场中对抗高爆发队伍时表现突出。
华佗的团队价值还体现在其灵活的技能机制上。青囊的主动治疗与被动范围回血可适应不同战斗节奏，而刮骨疗毒的驱散效果能针对性破解敌方减益战术。这使得华佗不仅能融入固定阵容，也可作为通用辅助填补各类队伍的生存短板。玩家需根据敌方阵容特点调整华佗的站位与技能优先级，而非机械套用固定搭配模式。
